Системата за управление на околната среда на „ТЕЦ Марица Изток 2” ЕАД получи европейски сертификат ISO 14001:2004 от оторизирания орган ТЮФ Рейнланд. Одитът бе проведен в началото на декември 2008 г. и установи, че изискванията за сертифициране в частта „Екология” са изпълнени.
Това е първият и единствен за България сертификат, издаден на голяма горивна инсталация и важи до 2012 г. Европейското признание се дължи на високите резултати по отношение на околната среда, постигнати най-вече през 2008 г. с пуска на сероочистващата инсталация за блокове 1 и 2.
Системата за управление на околната среда е част от Интегрираната система за управление на ТЕЦ 2, внедрена през 2005 г. В нея влизат още системата за управление на качеството и системата за управление на безопасността и здравето при работа, които получиха своите сертификати съответно през септември и декември 2006 г. Тази обща схема има за цел да обхване управлението на всички процеси, имащи отношение към качественото, екологично и безопасно производство на електроенергия.